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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6pogB_ | 2.76 | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: protein kinase c-binding protein nell2; |
Added to library: Sat May 9 08:50:00 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | F | C | S | E | R | H | N | C | M | E | N | S | I | C | R | N | L | N | D | R | A | V | C | S | C | R | D | G | F | R | A | L | R | E | D | N | A | Y | C | E | D | I | D | E | C | A | E | G | R | H | Y | C | R | E | N | T | M | C | V | N | T | P | G | S | F | M | C | I | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | T | G | Y | I | R | I | D | D | Y | S | C | T | E | H | D | E | C | I | T | N | Q | H | N | C | D | E | N | A | L | C | F | N | T | V | G | G | H | N | C | V | C | K | P | G | Y | T | G | N | G | T | T | C | K | A | F | C | K | D | G | C | R | N | G | G | A | C | I | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | V | C | A | C | P | Q | G | F | T | G | P | S | C | E | T | D | I | D | E | C | S | D | G | F | V | Q | C | D | S | R | A | N | C | I | N | L | P | G | W | Y | H | C | E | C | R | D | G | Y | H | D | N | G | M | F | S | P | S | G | E | S | C | E | D | I | D | E | C | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | S | C | A | N | D | T | I | C | F | N | L | D | G | G | Y | D | C | R | C | C | T | G | H | H | H | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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