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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ojmB_ | 1.60 | PDB header: lyase | Chain: B: PDB Molecule: 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coa synthase; |
Added to library: Sat May 11 08:34:11 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | I | E | W | K | T | A | K | E | Y | E | D | I | T | Y | K | K | C | N | G | V | A | R | I | A | F | N | R | P | E | I | R | N | A | F | R | P | K | T | T | S | E | L | Y | D | A | F | Y | D | A | Y | E | D | P | S | I | G | V | V | L | L | S | G | E | G | P | S | P | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | T | T | B | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | G | W | A | F | C | S | G | G | D | Q | K | A | R | G | H | Q | G | Y | V | G | E | D | G | R | H | R | L | N | I | L | E | V | Q | R | L | I | R | F | M | P | K | V | V | I | A | V | V | P | G | W | A | V | G | G | G | H | S | L | H | V | V | C | D | L | T | L | A | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | T | T | T | T | S | T | S | S | S | S | S | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | H | A | I | F | K | Q | T | D | A | D | V | T | S | F | D | G | G | Y | G | S | A | Y | L | A | K | M | V | G | Q | K | K | A | R | E | I | F | F | L | G | R | N | Y | S | A | Q | E | A | F | E | M | G | M | V | N | K | V | V | P | H | A | E | L | E | D | T | A | Y | E | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | Q | E | I | L | A | K | S | P | T | S | I | R | M | L | K | F | A | M | N | L | T | D | D | G | M | V | G | Q | Q | V | F | A | G | E | A | T | R | L | A | Y | M | T | D | E | A | K | E | G | R | N | A | F | L | E | K | R | K | P | D | F | G | E | D | Q | W | I | S | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | S | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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