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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6oh2A_ | 2.58 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: cmp-sialic acid transporter; |
Added to library: Sat Apr 27 08:39:08 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | C | L | T | V | M | T | L | V | A | A | A | Y | T | V | A | L | R | Y | T | R | T | T | A | E | E | L | Y | F | S | T | T | A | V | C | I | T | E | V | I | K | L | L | I | S | V | G | L | L | A | K | E | T | G | S | L | G | R | F | K | A | S | L | S | E | N | V | L | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | K | E | L | A | K | L | S | V | P | S | L | V | Y | A | V | Q | N | N | M | A | F | L | A | L | S | N | L | D | A | A | V | Y | Q | V | T | Y | Q | L | K | I | P | C | T | A | L | C | T | V | L | M | L | N | R | T | L | S | K | L | Q | W | I | S | V | F | M | L | C | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | T | L | V | Q | W | K | P | A | V | V | V | A | Q | N | P | L | L | G | F | G | A | I | A | I | A | V | L | C | S | G | F | A | G | V | Y | F | E | K | V | L | K | S | S | D | T | S | L | W | V | R | N | I | Q | M | Y | L | S | G | I | V | V | T | L | A | G | T | Y | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | G | A | E | I | Q | E | K | G | F | F | Y | G | Y | T | Y | Y | V | W | F | V | I | F | L | A | S | V | G | G | L | Y | T | S | V | V | V | K | Y | T | D | N | I | M | K | G | F | S | A | A | A | A | I | V | L | S | T | I | A | S | V | L | L | F | G | L | Q | I | T | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | A | L | G | A | L | L | V | C | V | S | I | Y | L | Y | G | L | P | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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