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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6oanD_ | 2.90 | PDB header: cell invasion | Chain: D: PDB Molecule: antibody 053054 single chain variable fragment; |
Added to library: Sat Jun 15 09:01:47 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | Q | L | Q | E | S | G | P | G | L | V | K | P | S | Q | T | L | S | L | T | C | N | V | S | G | D | S | I | N | S | G | D | Y | Y | W | I | W | I | R | Q | P | P | G | K | G | L | E | W | I | G | N | I | Y | Y | S | G | T | A | Y | Y | N | P | S | L | K | T | R | L | I | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | I | D | T | S | T | N | Q | F | S | L | K | V | T | S | V | T | A | A | D | T | A | I | Y | Y | C | A | R | A | S | T | T | V | V | S | P | W | L | D | P | W | G | Q | G | T | L | V | T | V | S | S | Y | E | L | T | Q | P | S | S | V | A | V | A | P | G | Q | T | A | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | C | G | G | D | N | I | E | S | K | G | V | H | W | Y | Q | Q | K | P | G | Q | A | P | V | L | V | V | Y | D | D | H | D | R | P | S | G | I | P | E | R | F | S | G | S | N | S | G | N | T | A | T | L | T | V | S | R | V | E | A | G | D | E | A | D | Y | Y | C | Q | V | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | T | S | S | E | H | P | V | F | G | G | G | T | K | L | T | V | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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