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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6mdxA_ | 1.55 | PDB header: dna binding protein/dna | Chain: A: PDB Molecule: sprt-like domain-containing protein spartan; |
Added to library: Sat Apr 13 08:21:16 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | S | L | V | D | A | S | W | E | L | V | D | P | T | P | D | L | Q | A | L | F | V | Q | F | N | D | Q | F | F | W | G | Q | L | E | A | V | E | V | K | W | S | V | R | X | T | L | C | A | G | I | C | S | Y | E | X | C | S | I | R | L | S | E | P | L | L | K | L | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | S | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | K | D | L | V | E | T | L | L | H | E | X | I | H | A | Y | L | F | V | T | N | N | D | K | D | R | E | G | H | G | P | E | F | C | K | H | X | H | R | I | N | S | L | T | G | A | N | I | T | V | Y | H | T | F | H | D | E | V | D | E | Y | R | R | H | W | W | R | C | N | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | ||||||||||||||
Sequence | P | C | Q | H | R | P | P | Y | Y | G | Y | V | R | A | T | N | R | E | P | S | A | H | D | Y | W | W | A | E | H | Q | K | T | C | G | G | T | Y | I | K | I | K | E | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | B | S | T | T | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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