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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6m9yD_ | 1.35 | PDB header: fluorescent protein | Chain: D: PDB Molecule: fluorescent protein lanfp6a; |
Added to library: Sat Mar 16 08:40:11 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | A | F | N | Q | Y | L | P | F | P | D | G | M | S | P | F | Q | A | A | M | Q | D | E | S | G | Y | Q | V | H | R | T | L | Q | Y | E | D | G | A | F | V | T | A | N | L | R | Y | T | Y | E | G | S | H | I | K | G | E | F | Q | V | I | G | T | G | F | P | P | D | G | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | T | N | K | L | T | A | L | D | W | S | V | V | K | F | V | Y | P | N | D | K | T | I | L | S | T | F | D | K | T | Y | T | T | T | D | G | K | R | Y | Q | C | T | F | R | E | N | N | T | F | A | K | P | M | A | A | D | I | L | Q | K | Q | P | M | F | I | F | H | K | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | Q | H | S | N | N | A | E | L | T | F | K | E | K | Q | T | A | F | S | D | M | K | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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