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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6m75A_ | 2.57 | PDB header: dna binding protein/dna | Chain: A: PDB Molecule: rna-binding motif, single-stranded-interacting protein 1; |
Added to library: Sat Mar 20 09:01:24 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | M | G | T | N | L | Y | I | R | G | L | P | P | H | T | T | D | Q | D | L | V | K | L | C | Q | P | Y | G | K | I | V | S | T | K | A | I | L | D | K | T | T | N | K | C | K | G | Y | G | F | V | D | F | D | S | P | A | A | A | Q | K | A | V | S | A | L | K | A | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Q | A | Q | M | A | K | Q | Q | E | Q | D | P | T | N | L | Y | I | S | N | L | P | L | S | M | D | E | Q | E | L | E | N | M | L | K | P | F | G | Q | V | I | S | T | R | I | L | R | D | S | S | G | T | S | R | G | V | G | F | A | R | M | E | S | T | E | K | C | E | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | G | H | F | N | G | K | F | I | K | T | P | P | G | V | S | A | P | T | E | P | L | L | C | K | F | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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