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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6m34A_ | 2.90 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: digeranylgeranylglyceryl phosphate synthase; |
Added to library: Sat Feb 6 08:45:01 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | M | E | K | L | K | T | Y | L | E | L | I | R | V | K | N | C | I | T | A | S | I | G | G | I | I | G | Y | L | I | S | S | N | F | E | I | D | I | L | K | S | L | L | V | F | F | V | V | F | F | V | C | A | Y | G | N | V | I | N | D | I | F | D | I | E | I | D | R | I | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | P | S | R | P | L | P | S | G | K | I | K | L | N | E | A | K | K | F | S | A | I | L | L | I | L | G | L | V | L | S | L | F | I | N | I | Y | A | L | I | I | A | V | I | N | A | L | F | L | Y | L | Y | A | K | K | Y | K | K | Y | K | P | I | G | N | F | I | I | G | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | G | S | V | F | L | F | G | G | V | A | G | K | N | V | M | P | V | V | I | L | F | L | C | S | L | L | S | I | W | G | R | E | I | V | K | D | F | E | D | M | E | G | D | K | K | E | G | V | I | S | L | P | I | K | Y | G | K | K | S | L | Y | F | A | T | F | L | V | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | B | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | V | I | L | S | P | L | P | Y | I | L | K | I | F | G | I | W | Y | L | I | L | I | A | I | C | D | I | L | F | I | Y | A | M | A | L | L | L | K | E | P | N | K | E | T | A | S | K | V | S | K | F | L | K | I | I | M | N | I | V | L | L | A | F | I | V | G | A | I | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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