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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6m1hA_ | 3.60 | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide type i |
Added to library: Sat Mar 14 08:35:10 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | K | E | Q | A | M | C | L | E | K | G | C | P | G | M | W | D | N | I | T | C | W | K | P | A | H | V | G | E | M | V | L | V | S | C | P | E | L | F | R | I | F | N | P | D | Q | D | M | G | V | V | S | R | N | C | T | E | D | G | W | S | E | P | F | P | H | Y | F | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | T | T | G | G | G | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | G | F | D | Q | D | Y | Y | Y | L | S | V | K | A | L | Y | T | V | G | Y | S | L | S | L | V | A | L | L | L | A | M | V | I | L | C | R | F | R | K | L | H | C | T | R | N | F | I | H | M | N | L | F | V | S | F | M | L | R | A | I | S | V | F | I | K | D | W | I | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | E | Q | D | S | N | H | C | F | I | S | T | V | E | C | K | A | V | M | V | F | F | H | Y | C | V | V | S | N | Y | F | W | L | F | I | E | G | L | Y | L | F | T | L | L | V | E | T | F | F | P | E | R | R | Y | F | Y | W | Y | T | I | I | G | W | G | A | P | L | V | F | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | V | W | A | T | L | R | L | Y | F | D | D | T | G | C | W | D | M | N | D | S | T | A | L | W | W | V | I | K | G | P | V | V | G | S | I | M | V | N | F | V | L | F | I | G | I | I | V | I | L | V | Q | K | L | Q | S | P | D | I | Y | L | R | L | A | R | S | T | L | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . |
Sequence | I | P | L | F | G | I | H | Y | T | V | F | A | F | S | P | E | N | V | S | K | R | E | R | L | V | F | E | L | G | L | G | S | F | Q | G | F | V | V | A | V | L | Y | C | F | L | N | G | E | V | Q | A | E | I | K | R | K | W | R | S | W | K | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T |
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