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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6lypB_ | 3.30 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: mechanosensitive ion channel protein 1, mitochondrial; |
Added to library: Sat Apr 18 08:35:06 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | W | G | A | L | E | D | P | A | R | Y | L | V | T | F | I | A | F | A | Q | I | A | A | M | V | A | P | T | T | A | I | A | Q | Y | F | S | P | T | V | K | G | A | V | I | L | S | L | V | W | F | L | Y | R | W | K | T | N | V | I | T | R | M | L | S | A | K | S | F | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | R | E | K | V | L | T | L | D | K | V | S | S | V | G | L | F | A | I | G | L | M | A | S | A | E | A | C | G | V | A | V | Q | S | I | L | T | V | G | G | V | G | G | V | A | T | A | F | A | A | R | D | I | L | G | N | V | L | S | G | L | S | M | Q | F | S | R | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | M | G | D | T | I | K | A | G | S | V | E | G | Q | V | I | E | M | G | L | T | T | T | S | L | L | N | A | E | K | F | P | V | L | V | P | N | S | L | F | S | S | Q | V | I | V | N | K | S | R | A | Q | W | R | A | I | A | S | K | I | P | L | Q | I | D | D | L | D | M | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | Q | I | S | N | E | I | K | E | M | L | R | S | N | T | K | V | F | L | G | K | E | A | P | H | C | Y | L | S | R | V | E | K | S | F | A | E | L | T | I | G | C | N | L | I | R | M | G | K | E | E | L | Y | N | T | Q | Q | E | V | L | L | E | A | V | K | I | I | K | K | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | B | S | S | S | S | S | B | B | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | V | S | L | G | T | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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