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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ltjN_ | 3.70 | PDB header: gene regulation | Chain: N: PDB Molecule: swi/snf complex subunit smarcc2; |
Added to library: Sat Feb 15 08:34:11 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | I | I | I | P | S | Y | A | A | W | F | D | Y | N | S | V | H | A | I | E | R | R | A | L | P | E | F | F | N | G | K | N | K | S | K | T | P | E | I | Y | L | A | Y | R | N | F | M | I | D | T | Y | R | L | N | P | Q | E | Y | L | T | S | T | A | C | R | R | N | L | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | S | T | S | S | T | T | S | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | C | A | I | M | R | V | H | A | F | L | E | Q | W | G | L | I | N | Y | Q | V | D | T | E | Q | E | T | L | L | L | L | E | A | L | E | M | Y | K | D | D | W | N | K | V | S | E | H | V | G | S | R | T | Q | D | E | C | I | L | H | F | L | R | N | P | V | M | S | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | F | L | A | S | V | V | D | P | R | V | A | S | A | A | A | K | S | A | L | E | E | F | S | K | M | L | S | T | A | A | A | A | A | L | A | A | A | A | V | K | A | K | H | L | A | A | V | E | E | R | K | I | K | S | L | V | A | L | L | V | E | T | Q | M | K | K | L | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | ||||||||||||||
Sequence | K | L | R | H | F | E | E | L | E | T | I | M | D | R | E | R | E | A | L | E | Y | Q | R | Q | Q | L | L | A | D | R | Q | A | F | H | M | E | Q | L | K | Y | A | E | M | R | A | R | Q | Q | H | F | Q | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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