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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6lthP_ | 3.00 | PDB header: gene regulation | Chain: P: PDB Molecule: swi/snf-related matrix-associated actin-dependent regulator |
Added to library: Sat Feb 15 08:40:45 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | K | K | M | A | D | K | I | L | P | Q | R | I | R | E | L | V | P | E | S | Q | A | Y | M | D | L | L | A | F | E | R | K | L | D | Q | T | I | M | R | K | R | L | D | I | Q | E | A | L | K | R | P | I | K | Q | P | P | Q | F | K | L | D | P | R | L | A | R | L | L | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | T | Q | T | R | P | V | I | I | Q | A | L | W | Q | Y | I | K | T | H | K | L | Q | D | P | H | E | R | E | F | V | I | C | D | K | Y | L | Q | Q | I | F | E | S | Q | R | M | K | F | S | E | I | P | Q | R | L | H | A | L | L | M | P | P | E | T | L | K | T | Q | M | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | B | S | S | S | T | T | B | B | T | T | T | T | T | T | S | S | S | B | G | G | G | T | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | L | L | S | T | A | S | Q | Q | E | I | A | T | L | D | N | K | I | H | E | T | I | E | T | I | N | Q | L | K | T | Q | R | E | F | M | L | S | F | A | R | D | P | Q | G | F | I | N | D | W | L | Q | S | Q | C | R | D | L | K | T | M | T | D | V | V | G | N | P | E | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | R | A | E | F | Y | F | Q | P | W | A | Q | E | A | V | C | R | Y | F | Y | S | K | V | Q | Q | R | R | Q | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | G | G | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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