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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6lthM_ | 3.00 | PDB header: gene regulation | Chain: M: PDB Molecule: swi/snf-related matrix-associated actin-dependent regulator |
Added to library: Sat Feb 15 08:33:44 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | T | F | G | Q | K | P | V | K | F | Q | L | E | D | D | G | E | F | Y | M | I | G | S | E | V | G | N | Y | L | R | M | F | R | G | S | L | Y | K | R | Y | P | S | L | W | R | R | L | A | T | V | E | E | R | K | K | I | V | A | S | S | D | H | G | Y | T | T | L | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | V | T | L | L | K | A | S | E | V | E | E | I | L | D | D | P | A | V | I | H | E | N | A | S | Q | P | E | V | L | V | P | I | R | L | D | M | E | I | D | G | Q | K | L | R | D | A | F | T | W | N | M | N | E | K | L | M | T | P | E | M | F | S | E | I | L | C | D | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | L | N | P | L | T | F | V | P | A | I | A | S | A | I | R | Q | Q | I | E | S | Y | P | Q | S | D | Q | R | V | I | I | K | L | N | I | H | V | G | N | I | S | L | V | D | Q | F | E | W | D | M | S | E | K | E | N | S | P | E | K | F | A | L | K | L | C | S | E | L | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | G | G | E | F | V | T | T | I | A | Y | S | I | R | G | Q | L | S | W | H | Q | K | T | Y | P | L | P | T | V | E | I | A | I | R | N | T | G | D | A | D | Q | W | C | P | L | L | E | T | L | T | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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