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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6lklB_ | 2.21 | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: abc transporter, solute-binding protein; |
Added to library: Sat Dec 5 08:56:05 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | V | L | T | V | Y | S | P | Y | Q | S | N | L | I | R | P | I | L | N | E | F | E | K | Q | E | H | V | K | I | E | I | K | H | G | S | T | Q | V | L | L | S | N | L | H | N | E | D | F | S | E | R | G | D | V | F | M | G | G | V | L | S | E | T | I | D | H | P | E | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | S | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | P | Y | Q | D | T | S | V | T | Q | Q | L | E | D | Y | R | S | N | N | K | Y | V | T | S | F | L | L | M | P | T | V | I | V | V | N | S | D | L | Q | G | D | I | K | I | R | G | Y | Q | D | L | L | Q | P | I | L | K | G | K | I | A | Y | S | N | P | N | T | T | T | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | B | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | G | G | G | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | Q | H | M | R | A | I | Y | S | M | H | H | R | V | S | D | V | H | Q | F | Q | N | H | A | M | Q | L | S | K | T | S | K | V | I | E | D | V | A | K | G | K | Y | Y | A | G | L | S | Y | E | Q | D | A | R | T | W | K | N | K | G | Y | P | V | S | I | V | Y | P | I | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | M | L | N | V | D | G | I | A | L | V | K | N | A | H | P | H | P | K | R | K | K | L | V | Q | Y | L | T | S | R | S | V | Q | Q | R | L | V | A | E | F | D | A | K | S | I | R | K | D | V | S | E | Q | S | D | Q | S | I | E | N | L | K | N | I | P | L | I | P | K | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | G | G | G | S | B | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | P | D | I | P | H | H | K | F | L | E | M | I | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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