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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6kybD_ | 2.80 | PDB header: lipid binding protein,transport protein | Chain: D: PDB Molecule: autophagy-related protein 18; |
Added to library: Sat Sep 12 09:34:35 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | S | D | S | S | P | T | I | N | F | I | N | F | N | Q | T | G | T | C | I | S | L | G | T | S | K | G | F | K | I | F | N | C | E | P | F | G | K | F | Y | S | E | D | S | G | G | Y | A | I | V | E | M | L | F | S | T | S | L | L | A | L | V | G | I | G | D | R | R | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | I | N | T | K | K | H | S | I | I | C | E | V | T | F | P | T | S | I | L | S | V | K | M | N | K | S | R | L | V | V | L | L | Q | E | Q | I | Y | I | Y | D | I | N | T | M | R | L | L | H | T | I | E | T | N | P | N | P | R | G | L | M | A | M | S | P | S | V | A | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | L | V | Y | P | S | N | G | D | V | I | V | F | N | L | E | T | L | Q | P | T | M | V | I | E | A | H | K | G | E | I | A | A | M | A | I | S | F | D | G | T | L | M | A | T | A | S | D | K | G | T | I | I | R | V | F | D | I | E | T | G | D | K | I | Y | Q | F | R | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | B | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | Y | A | T | R | I | Y | S | I | S | F | S | E | D | S | Q | Y | L | A | V | T | G | S | S | K | T | V | H | I | F | K | L | E | S | S | R | H | F | A | S | L | K | L | P | V | E | T | N | V | M | T | I | S | S | I | G | S | P | I | D | I | D | T | S | E | Y | P | E | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | M | V | P | I | R | V | V | S | S | D | G | Y | L | Y | N | F | V | M | D | P | E | R | G | G | D | C | L | I | L | S | Q | Y | S | I | L | M | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | S | S |
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