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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6kvmB_ | 1.90 | PDB header: immune system | Chain: B: PDB Molecule: mhc class ii beta chain 2; |
Added to library: Sat Dec 28 08:26:08 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | P | S | A | F | F | F | C | G | A | I | S | E | C | H | Y | L | N | G | T | E | R | V | R | Y | L | Q | R | Y | I | Y | N | R | Q | Q | Y | A | H | F | D | S | D | V | G | K | F | V | A | D | S | P | L | G | E | P | Q | A | E | Y | W | N | S | N | A | E | L | L | E | N | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | N | E | V | D | R | F | C | R | H | N | Y | G | G | V | E | S | F | T | V | Q | R | S | V | E | P | K | V | R | V | S | A | R | L | A | C | Y | V | T | G | F | Y | P | P | E | I | E | V | K | W | F | L | N | G | R | E | E | T | E | R | V | V | S | T | D | V | M | Q | N | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T | B | B | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | D | W | T | Y | Q | V | L | V | V | L | E | T | V | P | R | R | G | D | S | Y | V | C | R | V | E | H | A | S | L | R | Q | P | I | S | Q | A | W | E | P | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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