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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6koqF_ | 3.35 | PDB header: transcription | Chain: F: PDB Molecule: ecf rna polymerase sigma factor sigh; |
Added to library: Sat Mar 14 08:50:54 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | D | E | E | L | T | A | R | F | E | R | D | A | I | P | L | L | D | Q | L | Y | G | G | A | L | R | M | T | R | N | P | A | D | A | E | D | L | L | Q | E | T | M | V | K | A | Y | A | G | F | R | S | F | R | H | G | T | N | L | K | A | W | L | Y | R | I | L | T | N | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | N | S | R | S | A | E | V | E | A | L | E | A | L | P | D | T | E | I | K | E | A | L | Q | A | L | P | E | E | F | R | M | A | V | Y | Y | A | D | V | E | G | F | P | Y | K | E | I | A | E | I | M | D | T | P | I | G | T | V | M | S | R | L | H | R | G | R | R | Q | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | L | L | A | D | V | A | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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