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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6kmtC_ | 2.60 | PDB header: immune system | Chain: C: PDB Molecule: caspase-4; |
Added to library: Sat Mar 14 09:10:59 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | K | L | C | S | P | E | E | F | T | R | L | C | R | E | K | T | Q | E | I | Y | P | I | K | E | A | N | G | R | T | R | K | A | L | I | I | C | N | T | E | F | K | H | L | S | L | R | Y | G | A | N | F | D | I | I | G | M | K | G | L | L | E | D | L | G | Y | D | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | B | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | K | E | E | L | T | A | E | G | M | E | S | E | M | K | D | F | A | A | L | S | E | H | Q | T | S | D | S | T | F | L | V | L | M | S | H | G | T | L | H | G | I | C | G | T | M | H | S | E | K | T | P | D | V | L | Q | Y | D | T | I | Y | Q | I | F | N | N | C | H | C | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | G | G | G | G | G | S | B | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | L | R | D | K | P | K | V | I | I | V | Q | A | A | R | V | E | K | D | F | I | A | F | Y | S | T | T | P | H | H | L | S | Y | R | D | K | T | G | G | S | Y | F | I | T | R | L | I | S | C | F | R | K | H | A | C | S | C | H | L | F | D | I | F | L | K | V | Q | Q | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | S | S | G | G | G | S | B | S | S | S | S | B | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | K | A | S | Q | M | P | T | I | D | R | A | T | L | T | R | Y | F | Y | L | F | P | G | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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