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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6kmfB_ | 3.60 | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: major fimbrium subunit fima type-1; |
Added to library: Sat Apr 18 08:23:55 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | F | G | V | G | D | D | E | S | K | V | A | K | L | T | V | M | V | Y | N | G | E | Q | Q | E | A | I | K | S | A | E | N | A | T | K | V | E | D | I | K | C | S | A | G | Q | R | T | L | V | V | M | A | N | T | G | A | M | E | L | V | G | K | T | L | A | E | V | K | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | T | E | L | T | A | E | N | Q | E | A | A | G | L | I | M | T | A | E | P | K | T | I | V | L | K | A | G | K | N | Y | I | G | Y | S | G | T | G | E | G | N | H | I | E | N | D | P | L | K | I | K | R | V | H | A | R | M | A | F | T | E | I | K | V | Q | M | S | A | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | N | I | Y | T | F | V | P | E | K | I | Y | G | L | I | A | K | K | Q | S | N | L | F | G | A | T | L | V | N | A | D | A | N | Y | L | T | G | S | L | T | T | F | N | G | A | Y | T | P | A | N | Y | A | N | V | P | W | L | S | R | N | Y | V | A | P | A | A | D | A | P | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | B | B | S | S | S | S | S | S | B | B | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | F | Y | V | L | E | N | D | Y | S | A | N | G | G | T | I | H | P | T | I | L | C | V | Y | G | K | L | Q | K | N | G | A | D | L | A | G | A | D | L | A | A | A | Q | A | A | N | W | V | D | A | E | G | K | T | Y | Y | P | V | L | V | N | F | N | S | N | N | Y | T | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | B | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | N | Y | T | P | K | N | K | I | E | R | N | H | K | Y | D | I | K | L | T | I | T | G | P | G | T | N | N | P | E | N | P | I | T | E | S | A | H | L | N | V | Q | C | T | V | A | E | W | V | L | V | G | Q | N | A | T | W | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | S | B | S | S | T | T | S |
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