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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6kmdA_ | 2.20 | PDB header: oxidoreductase | Chain: A: PDB Molecule: phytochromobilin synthase; |
Added to library: Sat Dec 21 08:19:46 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | Y | K | K | L | I | H | F | A | L | E | E | T | N | T | H | T | L | L | S | P | S | P | L | Q | E | K | Y | S | S | L | L | S | X | D | D | K | T | E | L | Q | X | L | S | F | E | A | H | K | I | R | L | L | R | S | L | C | I | E | G | S | D | G | X | Q | V | L | D | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | G | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | F | P | K | P | E | F | D | L | P | I | F | C | A | N | F | F | T | T | A | K | X | N | I | I | V | L | D | L | N | P | L | H | D | I | X | D | Q | E | D | Y | K | E | K | Y | Y | K | D | L | I | T | L | G | L | K | Y | S | K | L | L | P | W | G | G | K | L | T | S | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | B | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | R | F | F | S | P | I | V | I | W | T | R | F | S | S | S | P | H | N | H | S | V | L | F | S | A | F | K | D | Y | Y | Q | A | W | L | G | L | X | D | R | S | E | G | E | T | D | A | S | Q | I | A | C | N | C | E | A | Q | H | R | Y | L | T | W | R | S | E | K | D | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | G | V | L | K | R | L | I | G | E | D | L | A | K | D | V | I | T | K | F | L | F | N | G | V | N | E | L | G | N | K | T | F | L | D | Y | F | P | E | Y | R | C | E | D | G | K | V | N | E | K | R | S | X | I | G | K | S | F | E | N | R | P | W | N | A | R | G | E | F | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | B | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | B |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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