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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6kfsA_ | 1.20 | PDB header: metal binding protein | Chain: A: PDB Molecule: lcib_c_ca domain-containing protein; |
Added to library: Sat Jul 18 08:32:00 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | E | T | T | M | A | K | V | Q | Q | A | F | P | G | A | A | T | N | D | Q | L | V | A | K | T | K | S | A | L | S | R | F | G | F | G | S | N | S | L | V | A | T | S | F | C | S | D | E | V | N | R | P | L | E | T | D | F | A | K | E | F | K | D | T | F | S | L | G | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | G | F | P | F | S | G | V | T | G | F | G | A | M | A | K | H | I | P | D | G | G | S | C | L | V | V | Y | G | P | H | V | G | V | D | L | D | G | N | V | G | T | V | N | R | R | G | R | E | K | G | G | T | C | C | G | S | A | V | A | A | A | G | Y | I | S | K | V | F | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | T | S | T | T | B | T | T | B | S | B | T | T | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | E | A | D | P | A | P | A | V | P | E | S | S | M | D | A | Q | Q | L | Y | V | G | N | M | L | L | P | Y | A | E | R | I | G | N | A | Q | D | A | M | V | E | L | P | Y | A | T | Y | E | P | L | D | D | L | M | Q | K | I | V | A | K | G | C | G | K | V | G | G | D | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G | S | S | S | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||
Sequence | I | A | L | L | G | G | L | Q | I | N | T | P | A | G | C | P | D | Y | F | L | P | L | R | F | E | V | R | D | N | Q | N | N | V | L | D | N | L | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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