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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6jyjA_ | 2.69 | PDB header: gene regulation | Chain: A: PDB Molecule: terminal nucleotidyltransferase 5b; |
Added to library: Sat Mar 7 08:54:26 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | P | R | F | S | V | L | S | W | P | Q | V | R | R | L | D | A | I | L | C | E | S | V | P | I | H | G | R | G | N | F | P | T | L | S | C | R | P | R | D | L | V | Q | V | V | R | S | R | L | E | Q | K | G | I | L | V | H | N | V | R | L | N | G | S | A | A | S | Y | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | H | D | S | G | L | G | Y | K | D | L | D | L | I | F | M | V | D | L | K | G | P | D | A | F | Q | V | V | K | H | A | V | L | N | C | L | L | D | F | L | P | S | G | V | K | I | T | P | M | T | L | K | E | A | Y | V | Q | K | L | V | K | V | C | T | E | S | D | R | W | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | I | S | L | S | N | N | S | G | K | N | M | E | L | K | F | V | D | S | L | R | R | Q | F | E | F | S | V | D | S | F | Q | I | I | L | D | S | M | L | M | F | S | Q | N | P | M | S | Q | S | F | H | P | T | V | T | G | E | S | M | Y | G | D | F | E | E | A | M | D | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | N | R | I | I | A | T | R | N | P | E | E | I | R | G | G | G | L | L | K | Y | C | N | L | L | V | R | G | F | R | P | K | S | E | V | D | M | K | T | M | Q | R | Y | M | C | S | R | Y | F | I | D | F | P | D | I | R | E | Q | Q | R | K | L | K | C | Y | L | Q | D | H | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||
Sequence | V | G | M | E | D | K | R | Y | D | Y | L | M | T | L | H | Q | V | V | N | E | S | T | V | C | L | M | G | H | E | R | R | Q | T | L | A | L | I | A | S | L | A | V | H | V | L | S | E | Q | N | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T |
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