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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ivyB_ | 2.00 | PDB header: structural protein | Chain: B: PDB Molecule: periplasmic ferric iron-binding protein hita; |
Added to library: Sat Dec 7 08:53:43 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | V | T | L | T | L | Y | N | G | Q | H | A | A | T | G | I | A | I | A | K | A | F | Q | D | K | T | G | I | Q | V | K | I | R | K | G | G | D | G | Q | L | A | S | Q | I | T | E | E | G | A | R | S | P | A | D | V | L | Y | T | E | E | S | P | P | L | I | R | L | A | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | L | L | A | K | L | E | P | E | T | L | A | L | V | E | P | E | H | A | G | G | N | G | D | W | I | G | I | T | A | R | T | R | V | L | A | Y | N | P | K | K | I | D | E | K | D | L | P | K | S | L | M | D | L | S | D | P | S | W | S | G | R | F | G | F | V | P | T | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | S | G | G | G | B | T | T | S | S | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | G | G | G | G | G | S | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | F | L | E | Q | V | A | A | V | I | K | L | K | G | Q | E | E | A | E | D | W | L | T | G | L | K | A | F | G | S | I | Y | T | N | N | V | T | A | M | K | A | V | E | N | G | E | V | D | M | A | L | I | N | N | Y | Y | W | Y | T | L | K | K | E | K | G | E | L | N | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | H | Y | F | G | N | Q | D | P | G | A | L | V | T | V | S | G | A | A | V | L | K | S | S | K | H | P | R | E | A | Q | Q | F | V | A | F | M | L | S | E | E | G | Q | K | A | I | L | S | Q | S | A | E | Y | P | M | R | K | G | M | Q | A | D | P | A | L | K | P | F | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | B | T | T | S | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | L | D | P | P | K | L | T | P | A | D | L | G | E | A | S | E | A | L | S | L | E | R | D | V | G | L | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T |
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