|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6iucC_ | 3.40 | PDB header: dna binding protein/dna | Chain: C: PDB Molecule: spooj regulator (soj); |
Added to library: Sat Feb 16 08:44:50 2019 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | M | S | E | I | I | A | V | A | N | Q | K | G | G | V | G | K | T | T | T | A | V | N | L | A | A | S | L | A | V | H | E | K | K | I | L | L | I | D | F | D | P | Q | A | N | A | T | S | S | L | G | F | R | R | D | K | I | D | Y | D | I | Y | H | V | L | I | G | R | K | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | S | Q | V | I | L | K | T | Q | M | P | F | L | D | L | V | P | S | N | L | G | L | A | G | F | E | K | T | F | Y | D | S | Q | D | E | N | K | R | G | E | L | M | L | K | N | A | L | E | S | V | V | G | L | Y | D | Y | I | I | I | D | S | P | P | A | L | G | P | L | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | G | G | G | G | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | S | L | S | A | A | H | S | V | I | I | P | I | Q | C | E | F | F | A | L | E | G | T | K | L | L | L | N | T | I | R | M | L | Q | K | S | T | N | P | K | L | K | I | R | G | F | L | P | T | M | H | V | P | Q | L | N | L | T | K | G | V | L | A | E | L | F | K | Y | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | B | T | T | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | ||
Sequence | S | E | F | F | R | D | S | A | T | G | E | Y | I | M | I | P | K | S | V | K | L | A | E | S | P | S | F | G | K | P | I | L | L | Y | D | I | K | S | N | G | S | I | A | Y | Q | K | L | A | Q | S | I | L | Q | G | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | B | B | T | T | T | B | B | G | G | G | G | T | T | T | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|