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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ikmg_ | 3.40 | PDB header: antimicrobial protein | Chain: G: PDB Molecule: polyamine transport protein; |
Added to library: Sat Dec 28 09:07:14 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | V | Q | L | V | E | T | G | D | E | V | K | T | P | G | A | S | V | K | V | S | C | K | V | S | G | Y | T | F | T | S | Y | G | I | S | W | V | R | Q | A | P | G | Q | G | L | E | W | M | G | W | I | N | P | N | S | G | G | T | N | Y | A | Q | K | F | Q | G | R | V | T | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | R | D | T | S | I | S | T | A | Y | M | E | L | S | R | L | R | S | D | D | T | A | V | Y | Y | C | A | R | D | K | R | Y | M | D | V | W | G | K | G | T | T | V | T | V | S | S | G | V | L | T | Q | P | P | S | V | S | G | A | P | G | Q | K | V | T | I | S | C | S | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | S | N | I | G | R | N | Y | V | S | W | Y | Q | Q | L | P | G | A | A | P | K | L | L | L | Y | D | N | N | K | R | P | S | G | I | P | D | R | F | S | A | S | K | S | G | P | S | T | T | L | A | I | T | G | L | Q | T | G | D | E | A | D | Y | F | C | G | V | W | D | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | R | A | V | L | F | G | G | G | T | K | L | T | V | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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