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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ig0B_ | 3.37 | PDB header: rna binding protein | Chain: B: PDB Molecule: type iii-a crispr-associated ramp protein csm4; |
Added to library: Sat Dec 22 10:08:45 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | Y | K | L | Y | I | M | T | F | Q | N | A | H | F | G | S | G | T | L | D | S | S | K | L | T | F | S | A | D | R | I | F | S | A | L | V | L | E | A | L | K | M | G | K | L | D | A | F | L | A | E | A | N | Q | D | K | F | T | L | T | D | A | F | P | F | Q | F | G | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | B | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | P | K | P | I | G | Y | P | K | H | D | Q | S | V | D | V | K | E | V | R | R | Q | A | K | L | S | K | K | L | Q | F | L | A | L | E | N | V | D | D | Y | L | N | G | E | L | F | E | N | E | E | H | A | V | I | D | T | V | T | K | N | Q | P | H | K | D | D | N | L | Y | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | A | T | T | R | F | S | N | D | T | S | L | Y | V | I | A | N | E | S | D | L | L | N | E | L | M | S | S | L | Q | Y | S | G | L | G | G | K | R | S | S | G | F | G | R | F | E | L | D | I | Q | N | I | P | L | E | L | S | D | R | L | T | K | N | H | S | D | K | V | M | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | T | T | A | L | P | V | D | A | D | L | E | E | A | M | E | D | G | H | Y | L | L | T | K | S | S | G | F | A | F | S | H | A | T | N | E | N | Y | R | K | Q | D | L | Y | K | F | A | S | G | S | T | F | S | K | T | F | E | G | Q | I | V | D | V | R | P | L | D | F | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | B | B | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | V | L | N | Y | A | K | P | L | F | F | K | L | E | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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