|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6ibbC_ | 2.12 | PDB header: membrane protein | Chain: C: PDB Molecule: succinate receptor 1; |
Added to library: Sat Aug 17 09:06:08 2019 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | C | E | N | W | L | A | L | E | N | I | L | K | K | Y | Y | L | S | A | F | Y | G | I | E | F | I | V | G | M | L | G | N | F | T | V | V | F | G | Y | L | F | C | M | K | N | W | N | S | S | N | V | Y | L | F | N | L | S | I | S | D | L | A | F | L | C | T | L | P | M | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | S | Y | A | T | G | N | W | T | Y | G | D | V | L | C | I | S | N | R | Y | V | L | H | A | N | L | Y | T | S | I | L | F | L | T | F | I | S | I | D | R | Y | L | L | M | K | F | P | F | R | E | H | I | L | Q | K | K | E | F | A | I | L | I | S | L | A | V | W | V | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | L | E | V | L | P | M | L | T | F | I | T | S | T | D | S | C | V | D | Y | A | S | S | G | N | P | K | Y | S | L | I | Y | S | L | C | L | T | L | L | G | F | L | I | P | L | S | V | M | C | F | F | Y | Y | K | M | V | V | F | L | K | K | R | S | Q | Q | Q | N | K | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | L | V | V | L | A | V | V | I | F | S | V | L | F | T | P | Y | H | I | M | R | N | V | R | I | A | S | R | L | D | S | W | G | C | S | Q | K | A | I | K | C | L | Y | I | L | T | R | P | L | A | F | L | N | S | A | V | N | P | I | F | Y | F | L | V | G | D | H | F | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | M | L | F | S | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|