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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6humJ_ | 3.34 | PDB header: proton transport | Chain: J: PDB Molecule: nad(p)h-quinone oxidoreductase subunit j; |
Added to library: Sat Jan 12 08:11:33 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | V | G | R | L | L | Q | S | Q | N | L | S | V | E | S | L | G | R | D | A | S | G | V | E | M | I | K | V | D | R | D | R | L | L | A | V | C | Q | T | L | Y | A | D | G | F | N | Y | L | R | C | Q | A | A | Y | D | S | G | P | G | Q | D | L | V | S | T | Y | H | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | B | S | B | S | S | S | S | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | S | D | N | A | D | R | P | P | E | V | R | I | K | V | F | V | P | R | D | D | P | R | V | P | S | V | Y | W | I | W | K | T | A | D | W | Q | E | R | E | S | Y | D | M | F | G | I | V | Y | E | G | H | P | N | L | K | R | I | L | M | P | E | D | W | V | G | W | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | S | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | K | D | Y | I | T | P | D | F | Y | E | L | Q | E | A | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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