|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6hinA_ | 4.10 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: 5-hydroxytryptamine receptor 3a; |
Added to library: Sat Nov 10 08:34:26 2018 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | P | A | L | L | R | L | S | D | H | L | L | A | N | Y | K | K | G | V | R | P | V | R | D | W | R | K | P | T | T | V | S | I | D | V | I | M | Y | A | I | L | N | V | D | E | K | N | Q | V | L | T | T | Y | I | W | Y | R | Q | Y | W | T | D | E | F | L | Q | W | T | P | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | D | N | V | T | K | L | S | I | P | T | D | S | I | W | V | P | D | I | L | I | N | E | F | V | D | V | G | K | S | P | N | I | P | Y | V | Y | V | H | H | R | G | E | V | Q | N | Y | K | P | L | Q | L | V | T | A | C | S | L | D | I | Y | N | F | P | F | D | V | Q | N | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | B | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | L | T | F | T | S | W | L | H | T | I | Q | D | I | N | I | T | L | W | R | S | P | E | E | V | R | S | D | K | S | I | F | I | N | Q | G | E | W | E | L | L | E | V | F | P | Q | F | K | E | F | S | I | D | I | S | N | S | Y | A | E | M | K | F | Y | V | I | I | R | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | L | F | Y | A | V | S | L | L | L | P | S | I | F | L | M | V | V | D | I | V | G | F | C | L | P | P | D | S | G | E | R | V | S | F | K | I | T | L | L | L | G | Y | S | V | F | L | I | I | V | S | D | T | L | P | A | T | A | I | G | T | P | L | I | G | V | Y | F | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . |
Sequence | C | M | A | L | L | V | I | S | L | A | E | T | I | F | I | V | R | L | V | H | K | W | L | R | V | G | Y | V | L | D | R | L | L | F | R | I | Y | L | L | A | V | L | A | Y | S | I | T | L | V | T | L | W | S | I | W | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|