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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6h4eB_ | 1.56 | PDB header: lyase | Chain: B: PDB Molecule: putative n-acetylneuraminate lyase; |
Added to library: Sat Jun 29 08:32:00 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | K | L | S | G | L | I | A | A | P | H | T | P | F | A | A | D | G | S | V | N | Y | P | V | I | D | D | I | A | K | H | L | I | A | T | G | V | T | G | A | Y | V | L | G | T | T | G | E | G | I | H | C | S | V | E | E | R | K | K | V | A | E | R | W | V | T | A | S | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | B | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | L | D | L | I | I | H | T | G | A | L | S | I | A | D | T | L | E | L | A | R | H | A | E | T | L | D | I | K | A | T | S | V | I | G | P | C | F | F | K | P | S | H | V | D | D | L | V | E | Y | C | R | L | A | A | A | S | A | P | S | K | G | F | Y | Y | Y | H | S | T | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | S | T | T | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | G | L | S | I | D | M | E | K | F | L | Q | A | A | G | K | V | I | P | N | L | S | G | M | K | F | N | S | P | D | M | Y | E | F | Q | R | C | L | R | V | E | G | G | K | Y | D | I | P | F | G | V | D | E | F | I | P | A | G | L | A | C | G | A | L | S | A | V | G | S | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | S | S | G | G | G | G | T | S | B | B | G | G | G | T | T | S | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Y | N | Y | A | A | P | L | Y | L | E | L | I | E | K | F | N | Q | G | D | H | Q | G | V | A | D | C | M | D | K | V | I | A | I | I | R | V | L | V | E | Y | G | G | V | A | A | G | K | V | A | M | Q | L | H | G | I | D | V | G | A | P | R | R | P | L | R | P | L | T | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | T | G | G | G | G | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | K | A | D | A | L | A | K | F | K | A | A | N | F | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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