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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6h3vA_ | 2.90 | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: envelopment polyprotein; |
Added to library: Sat Mar 2 09:37:26 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | E | D | C | W | K | N | E | E | L | K | E | D | C | V | G | P | L | I | A | P | K | D | C | T | D | K | D | H | K | T | Y | L | S | E | A | S | L | L | A | T | A | K | K | I | T | Q | V | D | A | E | N | V | E | I | L | G | K | T | M | E | S | A | I | R | V | I | E | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | T | Y | H | R | M | H | L | L | E | A | V | F | L | N | K | H | C | D | Y | Y | K | M | F | E | H | N | S | G | Y | S | Q | V | K | W | R | M | M | I | K | T | Q | H | F | D | I | C | A | L | Q | A | N | S | P | F | C | A | Q | C | I | A | D | N | S | C | A | Q | G | S | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | G | G | G | G | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | F | D | T | H | M | N | S | T | Y | S | S | K | V | D | N | F | K | H | D | F | S | L | F | L | R | I | F | E | A | A | F | P | G | T | A | Y | V | H | L | L | T | N | I | K | E | K | K | P | Y | Q | A | V | S | M | I | E | K | I | K | K | K | F | P | N | N | K | L | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | Y | L | D | F | G | K | Y | L | L | G | L | S | H | A | S | T | Y | E | L | Q | Q | R | Q | L | D | K | L | Y | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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