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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6gybU_ | 3.28 | PDB header: membrane protein | Chain: U: PDB Molecule: virb10 protein; |
Added to library: Sat Oct 27 08:52:43 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | T | L | L | E | R | R | I | L | A | E | S | G | P | V | T | L | A | K | P | I | S | N | P | D | G | L | L | V | R | G | T | Y | I | R | C | I | L | E | T | R | I | I | S | D | F | G | G | Y | T | S | C | I | V | T | E | P | V | Y | S | I | N | G | H | N | L | L | L | P | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | S | K | M | L | G | Q | Y | S | A | G | E | P | T | S | H | R | L | Q | V | V | W | D | R | V | T | T | P | T | G | L | D | V | T | L | M | G | P | G | I | D | T | L | G | S | S | G | H | P | G | N | Y | N | A | H | W | G | N | K | I | A | S | A | L | F | I | S | L | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . |
Sequence | D | A | F | K | Y | A | A | A | E | Y | G | P | E | P | F | E | S | N | T | A | R | S | M | Q | Q | L | A | E | Q | A | V | E | K | S | G | R | R | P | A | T | L | T | I | N | Q | G | T | V | L | N | V | Y | V | A | K | D | V | D | F | S | A | V | L | P | K | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | T | T | S | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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