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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ghbB_ | 3.10 | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: upf0413 protein gk0824; |
Added to library: Sat Apr 27 08:30:55 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | K | P | L | E | L | Y | L | F | I | D | P | L | C | P | E | C | W | G | L | E | P | V | I | K | K | L | T | I | E | Y | G | R | F | F | T | L | R | H | I | L | S | G | T | W | A | K | P | E | A | M | A | K | A | W | E | W | A | A | N | R | T | G | M | S | C | D | G | S | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | L | E | N | P | I | S | S | P | F | A | P | S | L | A | I | K | A | A | E | M | Q | G | K | R | A | G | L | R | F | L | R | K | L | Q | E | Q | L | F | L | E | K | Q | N | V | A | D | L | S | V | L | A | E | C | A | V | K | A | G | L | D | V | D | E | F | L | R | D | M | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | P | G | A | A | K | A | F | Q | C | D | L | K | I | T | S | E | M | D | V | D | E | I | P | T | L | V | L | F | N | E | N | I | E | D | E | G | I | K | I | S | G | C | Y | P | Y | D | I | Y | V | E | L | I | A | E | M | L | G | F | H | P | E | P | S | S | P | P | P | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | |||
Sequence | S | F | L | S | H | F | K | F | V | A | T | K | E | V | A | V | V | Y | N | W | T | I | Q | E | A | E | T | E | M | K | K | L | Q | L | K | Q | K | V | E | R | V | P | V | K | H | G | T | F | W | R | Y | I | D | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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