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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6g4ww_ | 4.50 | PDB header: ribosome | Chain: W: PDB Molecule: 40s ribosomal protein s15a; |
Added to library: Sat Jun 9 09:07:53 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | V | L | E | V | Y | R | G | V | R | E | V | L | S | K | Y | R | S | G | K | L | P | K | A | F | K | I | I | P | A | L | S | N | W | E | Q | I | L | Y | V | T | E | P | E | A | W | T | A | A | A | M | Y | Q | A | T | R | I | F | A | S | N | L | K | E | R | M | A | Q | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | N | L | V | L | L | P | R | V | R | D | D | V | A | E | Y | K | R | L | N | F | H | L | Y | M | A | L | K | K | A | L | F | K | P | G | A | W | F | K | G | I | L | I | P | L | C | E | S | G | T | C | T | L | R | E | A | I | I | V | G | S | I | I | T | K | C | S | I | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | H | S | S | A | A | M | L | K | I | A | E | M | E | Y | S | G | A | N | S | I | F | L | R | L | L | L | D | K | K | Y | A | L | P | Y | R | V | L | D | A | L | V | F | H | F | L | G | F | R | T | E | K | R | E | L | P | V | L | W | H | Q | C | L | L | T | L | V | Q | R | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | K | A | D | L | A | T | D | Q | K | E | A | L | L | E | L | L | R | L | Q | P | H | P | Q | L | S | P | E | I | R | R | E | L | Q | S | A | V | P | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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