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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6fkia_ | 4.30 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: atp synthase subunit alpha, chloroplastic; |
Added to library: Sat May 26 08:42:56 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | G | Q | H | F | Y | W | Q | I | G | G | F | Q | I | H | G | Q | V | L | I | T | S | W | V | V | I | A | I | L | L | G | S | A | A | I | A | V | R | S | P | Q | T | I | P | T | G | G | Q | N | F | F | E | Y | V | L | E | F | I | R | D | V | S | K | T | Q | I | G | E | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | P | W | V | P | F | I | G | T | M | F | L | F | I | F | V | S | N | W | S | G | A | L | L | P | W | K | I | I | Q | L | P | H | G | E | L | A | A | P | T | N | D | I | N | T | T | V | A | L | A | L | L | T | S | V | A | Y | F | Y | A | G | L | T | K | K | G | L | G | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | K | Y | I | Q | P | T | P | I | L | L | P | I | N | I | L | E | D | F | T | K | P | L | S | L | S | F | R | L | F | G | N | I | L | A | D | E | L | V | V | V | V | L | V | S | L | V | P | L | V | V | P | I | P | V | M | F | L | G | L | F | T | S | G | I | Q | A | L | I | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | T | L | A | A | A | Y | I | G | E | S | L | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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