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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ff4C_ | 16.00 | PDB header: splicing | Chain: C: PDB Molecule: snw domain-containing protein 1; |
Added to library: Sat Sep 1 08:29:36 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | A | L | A | I | Q | V | D | S | E | G | K | I | K | Y | D | A | I | A | R | Q | G | Q | S | K | D | K | V | I | Y | S | K | Y | T | D | L | V | P | K | E | V | M | N | A | D | D | P | D | L | Q | R | P | D | E | E | A | I | K | E | I | T | E | K | T | R | V | A | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | G | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | S | V | S | Q | K | V | A | A | A | M | P | V | R | A | A | D | K | L | A | P | A | Q | Y | I | R | Y | T | P | S | Q | Q | G | V | A | F | N | S | G | A | K | Q | R | V | I | R | M | V | E | M | Q | K | D | P | M | E | P | P | R | F | K | I | N | K | K | I | P | R | G | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | S | P | P | A | P | V | M | H | S | P | S | R | K | M | T | V | K | E | Q | Q | E | W | K | I | P | P | C | I | S | N | W | K | N | A | K | G | Y | T | I | P | L | D | K | R | L | A | A | D | G | R | G | L | Q | T | V | H | I | N | E | N | F | A | K | L | A | E | A | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | A | D | R | K | A | R | E | A | V | E | M | R | A | Q | V | E | R | K | M | A | Q | K | E | K | E | K | H | E | E | K | L | R | E | M | A | Q | K | A | R | E | R | V | Q | Y | D | Q | R | L | F | N | Q | S | K | G | M | D | S | G | F | A | G | G | E | D | E | I | Y | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | D | Q | A | W | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
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