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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ei1A_ | 1.73 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: zinc finger with ufm1-specific peptidase domain protein; |
Added to library: Sat Mar 10 08:39:18 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | Q | Q | E | E | D | R | K | R | R | S | E | E | S | R | Q | E | I | E | E | F | Q | K | L | Q | R | Q | Y | G | L | D | N | S | G | G | Y | K | Q | Q | Q | L | R | N | M | E | I | E | V | N | R | G | R | M | P | P | S | E | F | H | R | R | K | A | D | M | M | E | S | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | F | D | D | G | K | T | K | T | S | G | I | I | E | A | L | H | R | Y | Y | Q | N | A | A | T | D | V | R | R | V | W | L | S | S | V | V | D | H | F | H | S | S | L | G | D | K | G | W | G | C | G | Y | R | N | F | Q | M | L | L | S | S | L | L | Q | N | D | A | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | C | L | K | G | M | L | I | P | C | I | P | K | I | Q | S | M | I | E | D | A | W | K | E | G | F | D | P | Q | G | A | S | Q | L | N | N | R | L | Q | G | T | K | A | W | I | G | A | C | E | V | Y | I | L | L | T | S | L | R | V | K | C | H | I | V | D | F | H | K | S | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | P | L | G | T | H | P | R | L | F | E | W | I | L | N | Y | Y | S | S | S | P | K | V | V | C | T | S | K | P | P | I | Y | L | Q | H | Q | G | H | S | R | T | V | I | G | I | E | E | K | K | N | R | T | L | C | L | L | I | L | D | P | G | C | P | S | R | E | M | Q | K | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | B | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . |
Sequence | L | K | Q | D | I | E | A | S | S | L | K | Q | L | R | K | S | M | G | N | L | K | H | K | Q | Y | Q | I | L | A | V | E | G | A | L | S | L | E | E | K | L | A | R | R | Q | A | S | Q | V | F | T | A | E | K | I | P | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | S | S | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S |
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