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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6egxA_ | 4.06 | PDB header: virus | Chain: A: PDB Molecule: structural protein vp1; |
Added to library: Sat Jul 21 08:22:10 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | S | D | G | V | T | A | M | G | F | Q | S | L | D | T | Q | V | S | I | K | D | I | L | R | R | P | V | L | L | F | N | H | V | E | L | D | P | D | Y | T | G | F | F | I | P | I | M | P | P | S | R | M | M | Q | Y | K | S | G | D | K | E | T | S | F | Q | R | L | I | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | S | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | P | Q | A | A | I | M | N | L | F | R | F | W | R | G | S | L | R | Y | T | I | I | I | H | S | T | D | G | H | P | I | Y | V | T | H | V | P | H | T | G | N | R | V | Y | G | L | M | K | V | N | N | L | H | E | Y | T | K | V | P | I | F | G | C | G | L | T | T | E | M | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | P | S | V | N | P | S | I | C | V | E | V | P | F | D | T | E | N | N | W | A | V | T | F | D | E | D | A | Q | R | N | Y | S | W | R | D | K | G | D | T | V | T | G | H | L | V | V | T | P | V | V | S | V | Y | M | S | V | W | V | E | A | G | D | D | F | E | V | S | N | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | B | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | G | P | P | S | V | K | T | N | D | W | N | Y | A | F | S | D | E | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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