|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6dflA_ | 2.40 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: lipopolysaccharide core heptose(i) kinase rfap; |
Added to library: Sat Apr 6 08:36:50 2019 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | X | R | L | V | L | E | E | P | F | K | R | L | W | N | G | R | D | P | F | E | A | V | E | A | L | Q | G | K | V | Y | R | E | L | E | G | R | R | T | L | R | T | E | V | D | G | R | G | Y | F | V | K | I | H | R | L | G | A | R | Q | E | W | Q | A | I | R | R | L | H | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | B | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | V | A | T | X | T | A | V | A | Y | G | E | R | G | S | D | P | A | R | Q | H | S | F | I | V | T | E | E | L | A | P | T | V | D | L | E | V | F | S | Q | D | W | R | E | R | P | P | P | P | R | L | K | R | A | L | V | E | A | V | A | R | X | V | G | D | X | H | R | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | N | H | R | D | C | Y | I | C | H | F | L | L | H | T | D | K | P | V | S | A | D | D | F | R | L | S | V | I | D | L | H | R | A | Q | T | R | D | A | T | P | K | R | W | R | N | K | D | L | A | A | L | Y | F | S | A | L | D | I | G | L | T | R | R | D | K | L | R | F | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | S | B | T | T | B | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | ||||||||||||||||||
Sequence | R | T | Y | F | R | R | P | L | R | E | I | L | R | D | E | A | G | L | L | A | W | X | E | R | K | A | E | K | L | Y | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|