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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ddnB_ | 2.30 | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: probable sulfate-binding lipoprotein subi; |
Added to library: Sat May 18 08:20:07 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | T | S | I | T | L | V | A | Y | A | V | P | E | P | G | W | S | A | V | I | P | A | F | N | A | S | E | Q | G | R | G | V | Q | V | I | T | S | Y | G | A | S | A | D | Q | S | R | G | V | A | D | G | K | P | A | D | L | V | N | F | S | V | E | P | D | I | A | R | L | V | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | G | K | V | D | K | D | W | D | A | D | A | T | K | G | I | P | F | G | S | V | V | T | F | V | V | R | A | G | N | P | K | N | I | R | D | W | D | D | L | L | R | P | G | I | E | V | I | T | P | S | P | L | S | S | G | S | A | K | W | N | L | L | A | P | Y | A | A | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | G | G | R | N | N | Q | A | G | I | D | F | V | N | T | L | V | N | E | H | V | K | L | R | P | G | S | G | R | E | A | T | D | V | F | V | Q | G | S | G | D | V | L | I | S | Y | E | N | E | A | I | A | T | E | R | A | G | K | P | V | Q | H | V | T | P | P | Q | T | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | E | N | P | L | A | V | V | A | T | S | T | H | L | G | A | A | T | A | F | R | N | F | Q | Y | T | V | Q | A | Q | K | L | W | A | Q | A | G | F | R | P | V | D | P | A | V | A | A | D | F | A | D | L | F | P | V | P | A | K | L | W | T | I | A | D | L | G | G | W | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | D | P | Q | L | F | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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