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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6d8vA_ | 2.80 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: probable chemoreceptor (methyl-accepting chemotaxis) |
Added to library: Sat Apr 20 08:30:34 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | R | V | E | T | L | V | F | D | G | A | K | T | E | A | R | A | I | A | S | D | I | A | G | S | V | G | E | L | A | A | A | A | R | T | M | S | G | V | L | G | R | G | H | A | G | Q | S | T | D | R | A | G | A | I | N | L | L | K | A | N | L | E | Q | H | G | F | A | F | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | W | F | A | E | E | P | K | A | Y | D | G | K | D | V | I | D | N | T | E | R | G | G | N | A | D | G | A | F | T | P | Y | W | S | K | D | R | N | G | N | I | Q | L | S | T | F | K | A | D | Y | A | A | E | W | Y | G | L | A | A | K | S | G | K | G | A | I | T | Q | P | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | G | G | G | T | B | T | T | S | B | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | E | G | T | D | V | P | T | T | M | T | S | I | A | Y | P | V | M | S | N | G | R | M | I | G | V | S | G | V | D | I | S | L | A | A | L | A | D | R | L | S | A | V | K | P | F | G | S | G | R | V | Y | L | L | S | Q | S | G | K | W | L | A | A | P | I | P | E | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | B | S | S | G | G | G | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | M | K | E | Y | D | G | E | G | V | E | S | V | K | D | A | L | S | T | G | T | P | R | M | I | E | N | L | T | Y | D | G | N | E | P | F | D | R | V | V | Y | P | F | S | L | P | D | V | N | A | Q | W | L | V | L | V | D | V | P | R | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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