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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6d6tE_ | 3.80 | PDB header: transport protein | Chain: E: PDB Molecule: human gaba-a receptor subunit gamma-2; |
Added to library: Sat Jun 30 08:22:12 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | D | V | T | V | I | L | N | N | L | L | E | G | Y | D | N | K | L | R | P | D | I | G | V | K | P | T | L | I | H | T | D | M | Y | V | N | S | I | G | P | V | N | A | I | N | M | E | Y | T | I | D | I | F | F | A | Q | T | W | Y | D | R | R | L | K | F | N | S | T | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | L | R | L | N | S | N | M | V | G | K | I | W | I | P | D | T | F | F | R | N | S | K | K | A | D | A | H | W | I | T | T | P | N | R | M | L | R | I | W | N | D | G | R | V | L | Y | T | L | R | L | T | I | D | A | E | C | Q | L | Q | L | H | N | D | E | H | S | C | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | F | S | S | Y | G | Y | P | R | E | E | I | V | Y | Q | W | K | R | S | S | V | E | V | G | D | T | R | S | W | R | L | Y | Q | F | S | F | V | G | L | R | N | T | T | E | V | V | K | T | T | S | G | D | Y | V | V | M | S | V | Y | F | D | L | S | R | R | M | G | Y | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | Q | T | Y | I | P | C | T | L | I | V | V | L | S | W | V | S | F | W | I | N | K | D | A | V | P | A | R | T | S | L | G | I | T | T | V | L | T | M | T | T | L | S | T | I | A | R | K | S | L | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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