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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6d69A_ | 2.60 | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: nhl repeat region of d. melanogaster thin; |
Added to library: Sat Apr 27 08:48:07 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | A | G | T | I | P | K | Q | V | Y | L | R | K | R | Q | Q | L | F | Q | L | G | G | R | G | S | E | P | G | S | F | T | W | P | R | G | L | A | V | G | P | D | N | S | I | V | V | A | D | S | S | N | H | R | V | Q | V | F | D | S | N | G | I | F | V | K | E | F | G | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | B | S | S | S | T | T | B | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | N | G | E | G | E | F | D | C | L | A | G | V | A | V | N | R | I | G | Q | Y | I | I | A | D | R | Y | N | H | R | I | Q | V | L | D | P | Q | G | R | F | L | R | A | F | G | S | Q | G | T | A | D | G | K | F | N | Y | P | W | G | V | T | T | D | A | L | G | F | I | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S | B | S | S | S | T | T | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | D | K | E | N | H | R | V | Q | V | F | Q | S | D | G | S | F | V | G | K | F | G | S | C | G | R | G | E | G | Q | L | E | H | P | H | Y | I | A | V | S | N | T | N | R | V | I | V | S | D | S | N | N | H | R | I | Q | I | F | D | V | N | G | K | V | L | S | T | V | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | B | S | S | S | T | T | B | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | G | S | D | D | G | Q | F | K | F | P | R | G | V | A | V | D | D | Q | G | Y | I | F | V | A | D | S | G | N | N | R | I | Q | I | F | N | P | D | G | S | F | L | K | T | F | G | S | W | G | S | G | D | S | E | F | K | G | L | E | G | V | A | I | M | S | N | G | N | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | B | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | C | D | R | E | N | H | R | V | Q | V | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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