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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6cy1B_ | 1.90 | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: signal recognition particle receptor ftsy; |
Added to library: Sat May 5 08:35:13 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | V | S | W | F | K | K | I | F | K | K | E | E | K | E | S | L | D | K | G | L | E | K | S | S | Q | S | F | F | D | K | V | S | R | A | V | K | S | K | V | D | D | E | V | L | D | D | L | E | E | V | L | I | A | S | D | V | G | V | E | T | T | V | K | I | I | R | R | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | R | V | A | R | D | K | Y | V | N | V | A | E | L | N | N | I | L | R | E | E | I | S | G | L | L | L | E | N | P | H | A | G | T | K | K | P | Y | V | I | M | V | V | G | V | N | G | V | G | K | T | T | T | I | G | K | L | A | H | Q | F | K | S | E | G | L | K | V | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | A | A | D | T | F | R | A | A | A | V | D | Q | L | V | I | W | S | E | R | V | G | V | P | I | V | K | Q | A | M | G | S | D | P | A | S | V | A | F | D | T | V | Q | S | A | V | S | Q | D | A | D | V | V | I | I | D | T | A | G | R | L | H | N | K | V | N | L | M | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | S | K | I | K | R | V | M | Q | K | V | V | P | D | A | P | H | E | V | L | L | V | L | D | G | S | T | G | Q | N | A | F | E | Q | A | K | Q | F | T | A | A | T | E | V | T | A | L | A | V | T | K | L | D | G | T | A | R | G | G | V | V | I | G | I | S | D | Q | F | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | V | K | Y | I | G | V | G | E | K | M | Q | D | L | Q | L | F | N | G | T | E | F | V | D | S | F | F | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | T |
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