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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ckqA_ | UNK | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: transcription antitermination protein nusb; |
Added to library: Sat Apr 7 08:17:23 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | G | S | M | K | K | S | A | R | R | Q | S | R | E | L | A | T | Q | G | L | Y | Q | W | L | L | S | N | A | A | P | G | E | I | D | A | Q | L | R | G | A | L | G | Y | D | K | A | D | K | T | L | L | D | T | I | L | H | G | V | I | R | E | H | A | T | L | A | E | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | P | S | L | D | R | P | I | D | Q | L | S | P | V | E | R | A | V | L | L | I | A | T | Y | E | L | T | H | Q | I | E | T | P | Y | R | V | I | I | N | E | A | V | E | L | A | K | T | F | G | G | S | D | G | Y | K | Y | V | N | G | V | L | D | K | L | A | V | K | L | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | E | T | Q | A | R | R | G | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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