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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6bmsA_ | 2.44 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: palmitoyltransferase; |
Added to library: Sat Jan 13 08:23:27 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | C | C | Q | R | I | F | S | W | I | P | V | I | I | I | S | S | V | V | L | W | S | Y | Y | A | Y | V | F | E | L | C | F | V | T | N | N | L | E | R | V | T | Y | L | L | I | F | H | V | C | F | I | M | F | C | W | T | Y | W | K | A | I | F | T | P | P | S | T | P | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | F | H | L | S | Y | T | D | K | E | R | Y | R | P | E | V | Q | K | Q | I | L | V | D | I | A | K | K | L | P | I | F | T | R | A | Q | S | G | A | I | R | F | C | D | R | C | Q | V | I | K | P | D | R | C | H | H | C | S | V | C | E | T | C | V | L | K | M | D | H | H | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | B | T | T | T | T | T | S | B | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | W | V | N | N | C | V | G | F | S | N | Y | K | F | F | L | L | F | L | S | Y | S | M | I | Y | C | V | F | I | A | S | T | V | F | Q | Y | F | L | K | F | W | V | G | D | L | A | K | F | H | V | L | F | L | L | F | V | A | L | M | F | F | V | S | L | M | F | L | F | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | H | C | W | L | V | A | K | N | R | S | T | L | E | A | F | S | P | P | V | F | Q | N | G | P | D | R | N | G | F | N | V | G | L | S | K | N | L | R | Q | V | F | G | E | H | K | K | L | W | F | I | P | V | F | T | S | Q | G | D | G | H | Y | F | P | L | R | T | L | R | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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