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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6bbtB_ | 1.90 | PDB header: structural protein | Chain: B: PDB Molecule: major pilin backbone protein t-antigen, t13; |
Added to library: Sat Oct 27 08:25:07 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | A | G | V | V | T | G | K | T | L | P | I | T | K | S | M | I | Y | T | D | N | E | I | L | M | P | K | T | T | F | T | F | T | I | E | P | D | T | T | A | S | G | K | L | E | I | K | S | G | E | T | T | G | L | T | T | K | A | I | V | S | Y | D | N | T | D | K | E | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | N | K | T | S | N | F | N | F | E | T | V | T | F | S | G | I | G | I | Y | R | Y | T | V | S | E | Q | N | D | G | I | E | G | I | Q | Y | D | G | K | K | W | T | V | D | V | Y | V | G | N | K | F | E | P | K | Y | V | V | S | K | E | V | N | S | D | V | K | K | P | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | E | N | S | F | K | T | T | S | L | K | I | E | K | Q | V | T | G | N | Q | K | D | F | N | F | T | L | I | L | E | A | S | A | L | Y | E | K | G | Q | V | V | K | I | I | Q | D | G | Q | T | K | D | V | V | I | G | Q | E | Y | K | F | T | L | H | D | H | Q | S | I | M | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | K | L | P | I | G | I | S | Y | K | L | T | E | D | K | A | D | G | Y | T | T | T | A | T | L | K | E | G | E | I | D | A | K | E | Y | V | L | G | N | L | Q | K | T | D | E | S | A | D | E | I | V | V | T | N | K | R | D | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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