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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6b3xA_ | 2.30 | PDB header: gene regulation | Chain: A: PDB Molecule: cleavage stimulation factor subunit 1; |
Added to library: Sat Dec 2 08:49:54 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | F | G | I | D | L | E | F | Q | T | M | S | P | E | A | S | E | Y | E | T | C | Y | V | T | S | H | K | G | P | C | R | V | A | T | Y | S | R | D | G | Q | L | I | A | T | G | S | A | D | A | S | I | K | I | L | D | T | E | R | M | L | A | N | H | P | V | I | R | T | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | H | V | D | E | V | T | C | L | A | F | H | P | T | E | Q | I | L | A | S | G | S | R | D | Y | T | L | K | L | F | D | Y | S | K | P | S | A | K | R | A | F | K | Y | I | Q | E | A | E | M | L | R | S | I | S | F | H | P | S | G | D | F | I | L | V | G | T | Q | H | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | R | L | Y | D | I | N | T | F | Q | C | F | V | S | C | N | P | Q | D | Q | H | T | D | A | I | C | S | V | N | Y | N | S | S | A | N | M | Y | V | T | G | S | K | D | G | C | I | K | L | W | D | G | V | S | N | R | C | I | T | T | F | E | K | A | H | D | G | A | E | V | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | A | I | F | S | K | N | S | K | Y | I | L | S | S | G | K | D | S | V | A | K | L | W | E | I | S | T | G | R | T | L | V | R | Y | T | G | A | G | L | S | G | R | Q | V | H | R | T | Q | A | V | F | N | H | T | E | D | Y | V | L | L | P | D | E | R | T | I | S | L | C | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | W | D | S | R | T | A | E | R | R | N | L | L | S | L | G | H | N | N | I | V | R | C | I | V | H | S | P | T | N | P | G | F | M | T | C | S | D | D | F | R | A | R | F | W | Y | R | R | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | S | S | S | S | T | T | S |
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