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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6au8A_ | 1.80 | PDB header: chaperone | Chain: A: PDB Molecule: golgi to er traffic protein 4 homolog; |
Added to library: Sat Nov 4 08:25:05 2017 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | V | E | G | K | L | R | A | S | V | E | K | G | D | Y | Y | E | A | H | Q | M | Y | R | T | L | F | F | R | Y | M | S | Q | S | K | H | T | E | A | R | E | L | M | Y | S | G | A | L | L | F | F | S | H | G | Q | Q | N | S | A | A | D | L | S | M | L | V | L | E | S | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | A | E | V | E | V | A | D | E | L | L | E | N | L | A | K | V | F | S | L | M | D | P | N | S | P | E | R | V | T | F | V | S | R | A | L | K | W | S | S | G | G | G | K | L | G | H | P | R | L | H | Q | L | L | A | L | T | L | W | K | E | Q | N | Y | C | E | S | R | Y | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | L | H | S | A | D | G | E | G | C | A | N | M | L | V | E | Y | S | T | S | R | G | F | R | S | E | V | D | M | F | V | A | Q | A | V | L | Q | F | L | C | L | K | N | K | S | S | A | S | V | V | F | T | T | Y | T | Q | K | H | P | S | I | E | D | G | P | P | F | V | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | L | N | F | I | W | F | L | L | L | A | V | D | G | G | K | L | T | V | F | T | V | L | C | E | Q | Y | Q | P | S | L | R | R | D | P | M | Y | N | E | Y | L | D | R | I | G | Q | L | F | F | G | V | P | P | K | Q | T | S | S | Y | G | G | L | L | G | N | L | L | T | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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