|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6aq3C_ | 2.40 | PDB header: transport protein | Chain: C: PDB Molecule: trafficking protein particle complex subunit 3; |
Added to library: Sat Sep 2 08:25:24 2017 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | I | E | K | I | N | S | E | L | L | A | M | T | Y | G | S | L | V | T | Q | M | L | K | D | Y | E | D | V | A | A | I | N | T | Q | L | E | K | M | G | Y | K | M | G | M | R | L | I | D | E | F | M | S | K | S | G | L | S | S | G | A | C | R | E | F | K | D | T | A | E | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | K | V | A | F | K | M | F | L | G | I | N | A | N | V | T | N | W | S | K | D | Q | T | E | Y | S | I | V | F | D | E | N | P | L | N | D | F | V | E | L | P | E | P | I | K | Q | K | R | L | Y | Y | S | N | I | I | C | G | V | I | R | G | A | L | E | M | V | L | M | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | C | E | Y | K | K | C | P | L | L | G | D | D | Q | S | E | I | R | V | R | L | K | E | Y | L | R | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|